به طور خلاصه هر کدام از این دو سکانس پالسی مزایا و معایب خاص خود را دارند.
سکانس پالسی گرادیان اکو معمولا سریعتر است اما SNR کمتری نسبت به اسپین اکو دارد. به دلیل پالس های RF کوچکتر گرادیان اکو میزان SAR کمتری برای بیمار دارد.
همچنین سکانس های اسپویل شده ی گرادیان اکو به آرتیفکت های مربوط به غیریکنواختی میدان و اثرات T2* و پذیرفتاری مغناطیسی کاملا حساس اند که در اکثر مواقع دلخواه ما نیست.
اسپین اکو توسط پالس های دوباره همفاز کننده ی ۱۸۰ متعدد اثر T2* و پذیرفتاری مغناطیسی را کاهش می دهد و امکان تصویربرداری با وزن T2 واقعی را می دهد. اما به دلیل استفاده از پالس های ۹۰ و ۱۸۰ درجه زمان تصویربرداری در این سکانس ها بالاتر است.
در عمل گرادیان اکو بیشتر برای تصویربرداری های سریع و دینامیک متعاقب تزریق ماده ی حاجب به کار می رود و اسپین اکو برای ایجاد کانترست مناسب برای دید آناتومی مورد نظر کاربرد دارد.
